Habib 最近发表的 “DroNc-Seq” 方法描述了使用细胞核作为整个细胞的代理，以产生数千个单核转录组。这可以对不易分离或固定的细胞实现高通量的单细胞测序。与Drop-Seq 方案类似，用单个带有编码的珠子同单个核一同封装在一起（图1）。珠子的表面分布着含有（dT）30 片段的寡核苷酸，它可以捕获多腺苷酸化的mRNA，其在乳液破裂后被逆转录成cDNA。每个珠子除了带有的barcode 编码,还带有不同的UMI 位点识别编码，不仅可以识别单个细胞或细胞核，还可以识别来自细胞或细胞核的哪个转录组结合位点。与Drop-Seq 方案一样需要作出权衡，可以使用较稀浓度的细胞核和较高浓度的捕获珠，降低双细胞核概率，或者使用较高浓度的细胞核和捕获珠，提高捕获效率，但是会增高双细胞核概率。