深海荧光计是利用生物化学发光技术将不可见的ATP浓度变为可见光输出，从而以定量的结果简介显示微生物的数量。数值位于0-999999之间，以相对光单位RLUs表示。虽然RLU并不是一个实实在在的光强度单位，但深海荧光计能够为ATP生物化学发光检测提供一种真实有效的检测方法。1RLU约等于1fmol的ATP。RLU读数可以与用户设定的限值范围相比较，提供全面的结果限值，即通过、警戒或超标。采用化学反应检测ATP，用ATP拭子采集标本。ATP拭子被缓冲液浸湿，有助于从干燥或湿润的表面提取生物物质（ATP）。拭子也含有一种可以冲破生物膜的试剂，使其下可能存在的生物体暴露出来。微生物数量与微生物体内所含ATP有明确的相关性，通过检测ATP含量，便可以间接得出反应中微生物的数量。