现在应用超高频RFID设备的一个重要因素就是他的安全性，这也是很多企业在选择使用RFID技术应用时非常顾虑的一点。RFID标签的安全性最多只能跟读取它的RFID读写器的安全性一样高。换言之，高级RFID标签上的64位加密算法只有在标签读写器或主机支持这种64位加密算法时才有用。
与RFID标签一样，目前市面上大多数的超高频读写器还只支持程度的安全性，并采用老旧的加密算法和太短的密钥长度，这使得它们很容易被破解。安全性更高的新型读写器将支持高级的加密算法，同时也支持更简单的加密算法。它们还允许采用密码保护，并允许在RFID标签上的多个加密区中采用可选的加密算法。
俗话说得好，变化才是永恒的。安全和RFID应用领域也是如此。加密算法在不断更新和改进，密钥越来越长和*。由于RFID是一个新兴技术，预计RFID标签上的功能集将随时间而继续演进，以适应不断变化的供应链要求。
在选择RFID标签和超高频读写器时应记住，有些读写器只能通过手动改变设备中的硬件来进行升级。试想一下，如果要派遣设备维护人员前往建筑物的每一个入口处拆卸和更新每一个超高频读写器，到从制造商到消费者这一供应链的每一个环节上拆卸和更新数以千计的读写器，这将是一件非常麻烦的事。灵活性是RFID系统的关键特性，如艾特姆射频科技（AITGM）研发的新一代GM-UH202-4P四通道固定式超高频读写器只需上载新的固件，即可让网络中的所有设备通过网络进行升级。
