赛默飞离子色谱仪分离的原理是基于离子交换树脂上可离解的离子与流动相中具有相同电荷的溶质离子之间进行的可逆交换和分析物溶质对交换剂亲和力的差别而被分离。适用于亲水性阴、阳离子的分离。赛默飞离子色谱仪基本的组件是流动相容器、高压输液泵、进样器、色谱柱、检测器和数据处理系统。此外，可根据需要配置流动相在线脱气装置、自动进样系统、流动相抑制系统、柱后反应系统和全自动控制系统等。
赛默飞离子色谱仪操作注意事项：
1、流动相瓶中滤头要注意始终处于液面以下，防止将溶液吸干。
2、启动泵前观察从流动相瓶到泵之间的管路中是否有气泡，如果有则应将其排除。
排除方法如下：先将与泵相连的塑料流路接头拧下来，用洗耳球吸满去离子水，从与泵段相连的流路管中注入，将流路管中的气泡排除干净。然后再将流动相瓶，再将泵排气阀拧紧。
3、用去离子水或流动相清洗整个流路时，可以采用大流量清洗以缩短清洗时间，但在通流动相接色谱柱时需要将流量调整为色谱柱使用流量条件。
赛默飞离子色谱仪操作如下：先将泵停止，再按动正号或负号，将光标调整至流量位置，按下确认键，再通过调节正负号将流量调节至色谱柱使用条件后，再按确认键。此时需要等待5s后再启动泵开关。接色谱柱时注意先将接头在色谱柱前端抵上2-5s，将色谱柱前端气泡排除后再将接头拧紧。待色谱柱下端流出溶液后，在将色谱柱下端接头拧上。
4、使用阴离子色谱柱检测，通流动相时注意将电流旋钮打开，调节至90-100mA，使用完毕后要将电流旋钮关闭。
5、进样时阀的扳动要注意，不能太快，以免损伤阀体;也不能太慢，以免造成样品流失。在进样过程中，要严格按清洗程序操作，以减小前次样品残留对本次检测的影响。
作为赛默飞离子色谱仪的使用者来说，学会正确处理仪器使用中出现的故障也是必须要学会的一个技能，离子色谱仪长期使用。出现点小毛病也是在所难免的，也并不是说厂家生产的产品质量有问题，无论什么东西使用时间长了都会有一些小毛病的，因此自己学会一些简单的维修方法才是*。
