进口C18色谱柱一般比常规高效液相色谱分析柱价格要贵很多，但如果正常使用，离子色谱柱也可以有很长的使用寿命，因此对离子色谱的维护和清洗十分重要。一般而言，没有统一维护和清洗步骤，不同类型不同商家的离子色谱在说明书均有十分详细的说明，用户在使用前一定要注意仔细阅读。
进口C18色谱柱工作流程是高压将流动相以稳定的流速（或压力）输送至分析体系，在 色谱柱之前通过 进样器将样品导入，流动相将样品带入色谱柱，在色谱柱中各组分被分离，并依次随流动相流至 检测器。抑制型离子色谱则在电导检测器之前增加一个抑制系统，即用另一个高压将再生液输送到抑制器。在抑制器中，流动相背景电导被降低，然后将流动出物导入电导池，检测到的信号送至数据处理系统记录、处理或保存。非抑制型离子色谱仪不用抑制器和输送再生液的高压泵，因此离子色谱柱结构相对比较简单，价格也相对比较便宜。
1.离子色谱柱的维护，其原则如下：
a.确保离子色谱柱不干燥;
b.确保离子色谱柱不长霉;
c.确保离子色谱柱不进入颗粒物;
d.确保离子色谱柱不进入不可逆吸附物，特别是有机污染物;e.确保离子色谱在一定的流速、压力条件运行;2.离子色谱柱见的问题如下：
a.柱压升高，检查流路没有阻塞的前提下，更换色谱柱过滤网板，一般情况下更换保护柱进口端的网板。
b.分离度降低，可以是由于色谱柱的柱效降低或选择改变所引起的，可以通过适合的清洗对离子色谱柱进行清洗，或者改变离子色谱的流动相来改善分离。
c.死体积增大，由于分离柱入口树脂压力使树脂造成空隙或者树脂压碎而成，使离子色谱分离度下降、分叉等，这时可以填充相同类型的树脂和惰球树脂球以减少死体积。
而对于受污染的离子色谱柱，一般要进行清洗，清洗前一定要将色谱柱与抑制器断开，保护柱和分离柱分开清洗，或者将保护柱接在分离柱之后进行清洗。
3.清洗的原则是：
a.用高浓度的淋洗液清洗强保留的污染物;b.用有机酸如草酸、酒石酸、柠檬酸等清洗金属污染物;c.用有机溶剂兼容的浓度清洗有机污染物;d.清洗之后，必须用二次去离子水平衡，再用淋洗液平衡。
