大气采样器属于精密仪器，所以在使用过程中会非常繁琐，但是为了保证大气采样器的良好运行，我们必须要遵循以下十条才能保证它的长久使用。
1.采样前将吸收瓶盛上与采样吸收液同量的水，用胶管连好气路后开机，流量调至采样的实际流量，以免现场调试引起流量误差。
2.让仪器处于采样工作状态，来回转动调节钮，观察流量计是否灵活，有无死区，浮子是否稳定等。
3.在采样过程中，接上过滤器，一方面对空气进行过滤，因大气中的灰尘、气溶胶、酸碱气等杂物很容易随气流被抽吸到泵内，这些杂物附在网片上就会影响隔膜泵的流量、抽气压力和稳定性，使仪器的技术性能下降;另一方面，在发生倒吸溶液时，溶液一旦流经过滤器的过滤纤维，过滤纤维马上膨胀，堵塞进气通道，溶液便不会进一步流入隔膜泵内，对泵起到很好的保护作用。若发生倒吸溶液时，只需清洗过滤器，重新换上过滤纤维和泡沫塑料块可解决问题。
4.大气采样器操作中偶尔不慎，倒吸入酸碱溶液，应马上注入蒸馏水清洗几次，并让泵间歇地开动一段时间，然后再用无水乙醇溶液注入清洗几次(清洗时泵的出口脱离缓冲器和流量计等，另接胶管排液)。随后，分别把缓冲器、流量计等清洗好，待干后才能使用。把仪器恢复后，让仪器空转半小时左右或在出口处嗅不到酒精味时才能正常使用，一般都可恢复正常。
5.使用频繁或使用时间较长，也要更换过滤器内的过滤纤维和泡塑块，以免脏物穿过滤质进到泵内，防止气阻增大，使流量降低。
6.仪器使用时间较长或观察到流量计不灵活或不稳时，要对流量计进行清洗，这样，才能保证整机处于良好的工作状态。
7.当发现干燥瓶的干燥剂由兰变红时，应及时更换。在换干燥剂后，接好管路系统，不得漏气。
8.一般仪器是不防爆的，切勿在有爆炸危险的场所使用。
9.当仪器长期停放时，应将机内电池取出，并定期对仪器通电运行半小时，以驱除机内的潮气。
10.大气采样器使用时，吸收瓶的进出口不得接反，以免吸收剂吸入泵内造成故障。
