如今，我国自然村的生活污水的排放是较为落后的，大致分为两种方式，如：直接洒向地面或者排进附近的河道或者下水道。这样时间久了，无系统化管理，会堆积很多问题。虽然建有专门的化粪池，然而没有有效的实施排放，却加剧了对环境的污染。
无科学合理的规划；即使有排水系统，绝大多数也是合流制排水，且一般采用明沟排水，由于没有科学、合理地进行规划，加之农药的大量使用、畜禽粪便随雨水流入沟渠，一到晴天气味难闻，严重污染着农村生活环境。
未经处理直接排放；农村往往有灌渠贯穿其中，随着各家各户普遍使用冲水厕所，各种污废水未经处理大量排入灌渠，对农业灌溉用水污染颇大。
设施不*，管理滞后；自然村落生活污水处理尚处于起步阶段，污水处理设施不配套或不*，其建设与运行管理相对滞后。
