电机的圆周运动，通过机械装置使水泵内部的隔膜做往复式运动，从而压缩、拉伸泵腔(固定容积)内的空气，在单向阀作用下，在排水口处形成正压(实际输出压力大小跟泵排水口受到的阻力和泵的特性有关)；在抽水口处形成真空，从而与外界大气压间产生压力差。在压力差的作用下，将水压入进水口，再从排水口排出。在电机传递的动能作用下，水持续不断的吸入、排出，形成较稳定的流量。

简单示意图如下：

由此可见，水泵抽水口能提供的负压越大，表示这个压力差就越高，泵能自吸的高度(吸程)也就越高，但不可能高过10.3米 (1个大气压最多=10.3米水柱产生的压强) ！要知道微型水泵受限于体积，功率都不可能太高的，所以以前曾经用的一款微型隔膜水泵BSP27250S能到5米的自吸高度就很不容易了。

微型水泵根据内部构造可以分为：隔膜式、旋片式(叶轮式)、活塞式(柱塞式)等等，其中微型隔膜水泵简单工作原理如下：